Očkovanie proti Covidu – otázky a odpovede

V poslednej dobe som o tomto debatovala s rôznymi ľuďmi. Nie o všetkom so všetkými, ale keď už som to mala spísané, tak som si povedala, že to dám aj sem. (Ako inak, s disclaimerom: nie som doktorka medicíny, iba človek, čo číta tie internety…) Možno má niekto podobné otázky. 
 
Prečo J&J stačí jedna dávka, keď iná vakcína (AZ) na rovnakom princípe (adenovírus) potrebuje dve?
Možno by sa efektivita J&J ešte zvýšila, keby mala aj druhú dávku. Možno by stačilo mať aj jednu dávku AZ. Odpoveď ani na jednu z týchto dvoch otázok nemáme, pretože každá z nich bola testovaná s tým svojím protokolom. Máme trochu tušenie o AZ, lebo tam sú dáta z obdobia po prvej dávke pred druhou dávkou, ale vzhľadom na to, že potom prišla druhá dávka, tak dlhodobé pozorovania po jednej dávke AZ nie sú. 
Celé to súvisí s tým, ako sa testujú vakcíny (a lieky). Stanoví sa protokol, hypotéza a tie sa vyhodnocujú. J&J si jednoducho stanovili iný protokol. Keď sa ich na to pýtali, tak povedali:
“J&J representatives said they chose to begin with the single shot because the World Health Organization and other experts agreed it would be a faster, more effective tool in an emergency.”
Možno bude AZ v ďalšom testovať aj jednodávkový protokol, J&J už testuje dvojdávkový protokol – druhá dávka po 57 dňoch. Zatiaľ môže každý s čistým svedomím ponúkať len to, čo má a na čo má dáta.
Mimochodom, Pfizer aj AZ zbierajú dáta po jednej dávke a ukazujú 80% účinnosť čo sa týka hospitalizácií aj pre 70+.
 
Je Astra-Zeneca menej účinná ako Pfizer alebo Moderna?
Sú dva hlavné parametre, ktoré sú pri vakcínach zaujímavé:
Jeden je účinnosť v percentách: Moderna a Pfizer uvádzajú okolo 95%, J&J okolo 66/82% (66 overall, 82 severe), AZ okolo 82% (ak je druhá dávka po 12 týdňoch). Toto číslo neznamená, že 5% ľudí zaočkovaných Pfizerom a 18% ľudí zaočkovaných AZ dostane Covid. To číslo znamená, že ľudia zaočkovaní Pfizerom budú mať 95% menšiu šancu, že budú mať symptomatický priebeh choroby oproti placebo skupine. Rovnako 66% J&J znamená, že títo ľudia budú mať 66% menšiu šancu, že budú mať symptomatický covid. To 82% pri J&J znamená, že títo ľudia majú 82% menšiu šancu, že budú mať ťažký priebeh oproti placebo skupine.
Ten druhý parameter je, koľko zaočkovaných bude hospitalizovaných a/alebo zomrie. A toto majú všetky vakcíny spoločné. V tých zaočkovaných skupinách v RCT (randomized controlled trials, desiatky tisíc ľudí pre každú vakcínu) nemali hospitalizácie a nikto im nezomrel zatiaľčo v placebo skupinách áno. Takže z tohto jasne vychádza, že si treba proste dať takú vakcínu, ktorá je dostupná. Možno bude treba niekedy časom preočkovanie, možno s vakcínou ešte človek prekoná covid s ľahším priebehom, ale hociktorá z týchto dostupných vakcín je v aktuálnej situácii lepšia ako žiadna vakcína. 

Kedy druhú dávku AZ?
Toto je podobné, ako pri tom porovnávaní vakcín. Vyzerá, že s druhou dávkou AZ sa oplatí čakať dlhšie (v štúdii mali lepšie výsledky s 12 týždňovým rozostupom oproti 6 týždňovému rozostupu, a to je stále viac ako ten 4 týždňový, ktorý sa robí teraz na Slovensku). Ale zase, tie čísla hovoria o pravdepodobnosti, že zaočkovaná osoba bude mať symptomatický priebeh v porovnaní s placebo osobou. Ale bez ohľadu na rozostup dávok, v tých zaočkovaných skupinách nemajú hospitalizácie a úmrtia.

Ako je to s ochranou proti variantom?
Ako prví testovali vakcíny Pfizer a Moderna a vtedy ešte neboli také rozšírené rôzne varianty. Ani Pfizer ani Moderna nemajú RCT s variantmi. Obe majú sľubné laboratórne výsledky, s tým, že proti juhoamerickému variantu je trochu nižšia ochrana. Je dosť možné, že keby oni robili svoje štúdie v tom istom čase ako AZ, tak by im vyšli podobné výsledky.

Záver?
Treba sa proste dať zaočkovať hociktorou z týchto vakcín (Moderna, Pfizer, AZ, J&J), dokonca aj keby to malo byť len jednou dávkou dvojdávkovej vakcíny, vpodstate hneď ako sa dá. 

Víkendové surfovanie

Tentokrát opäť rozdelené na dve hlavné kategórie: covid a ne-covid. Vyberte si tú svoju.

Soňa Szomolányi: Naše zatvorené školy a podceňovanie vedomostí a dát spolu súvisia

Nie je náhoda, že Slovensko má v porovnaní so západoeurópskymi krajinami školy zatvorené najdlhšie. V európskych krajinách majú školy prioritu nielen vo vládnom programe. Kým u nás vláda dáva jednoznačne prednosť ekonomike – pričom sa ukazuje, že veľké pracoviská sú významným ohniskom infekcie. Štát nariaďuje testovať rodičov, avšak nič také nevyžaduje od priemyslu, kde bez rúšok a respirátorov trávia ľudia hodiny bez sociálnej dištancie. Nechcem znižovať riziko infekcie na školách. Málokto si dnes však uvedomuje, ako súčasná situácia prehĺbi priepasť medzi deťmi, ktoré vyrastajú v lepších a v slabších podmienkach a aké to bude mať dlhodobé dôsledky.

V čom absolútne zlyhávame? V neorganizovanej prednemocničnej starostlivosti.

Za rok pandémie sa nikto ani nepokúsil vybudovať Covid ambulancie, kde by bolo možné bezpečne vyšetriť a liečiť aspoň v rámci aktuálnych znalostí pozitívnych pacientov. Kde by mohli dostať kyslíkovú alebo infúznu liečbu. Kde by sa dala včas nasadiť liečba a minimalizovať tak potreba hospitalizácie. Mnohým by pomohla  aj domáca kyslíková liečba prenosným koncentrátorom kyslíka. Mohol by ich štát nakúpiť a požičiavať? Je nejaká služba, ktorá by prišla pacientovi podať infúziu domov? Je to samozrejme rizikové, ale verím, že za slušný rizikový príplatok by sa našli zaočkovaní zdravotníci, ktorí by do toho išli. Neverím, že je veľa iných štátov na svete (alebo aspoň v strednej a západne Európe), kde by takto kašľali na to, ako je o Covid pacientov postarané.

Pôrod v čase korony: zrazu všetci zmizli – podpíšte otvorený list, ktorý občianske združenie Ženské kruhy adresuje Ministerstvu zdravotníctva. Združenie sa aktívne snaží o to, aby sa takéto veci nestávali. 

Hoci negatívny výsledok PCR testu zbavil Luciu a Janu stigmy „rodička s covidom“,  nie je to happy-end. Ich príbehy ukazujú, že ani po roku pandémie COVID-19 nie sú mnohé slovenské nemocnice pripravené poskytovať tehotným a rodiacim ženám s týmto ochorením adekvátnu, bezpečnú a rešpektujúcu zdravotnú starostlivosť.

doma vyrobená vakcína

Back in December, I asked how hard it would be to make a vaccine for oneself. Several people pointed to radvac. It was a best-case scenario: an open-source vaccine design, made for self-experimenters, dead simple to make with readily-available materials, well-explained reasoning about the design, and with the name of one of the world’s more competent biologists (who I already knew of beforehand) stamped on the whitepaper. My girlfriend and I made a batch a week ago and took our first booster yesterday.

This post talks a bit about the process, a bit about our plan, and a bit about motivations. Bear in mind that we may have made mistakes

How do you capture the heartbreaking horror of nearly half a million deaths?

aspoň niečo na odľahčenie: Your Guide to Parenting Teenagers in a Pandemic

Get plants. Overwater them until they die. Replace plants. This is better than overwhelming your children with this kind of attention that has to go somewhere.

———————————————————————————————————————

Nakreslite si ľadovec a pozrite, ako bude plávať. (Dali sme si s deťmi potom aj súťaž, že kto nakreslí taký, ktorý sa už nepohne.) Jeden z mojich:

Jeden z Kikiných:

Jeden z Kubkových:

same energy – visual search engine

hiking is an ideal structure for friendship

Beautiful Yet Unnerving Photos of the Arctic Getting Greener

Inside Xinjiang’s Prison State

It is likely the largest internment of ethnic and religious minorities since the Second World War.

Víkendové surfovanie

vyhlásenie senátu UK k akademickej samospráve (pod toto vyhlásenie sa podpísala aj naša fakulta a neskôr aj celá univerzita)

Novelu vysokoškolského zákona, ktorú aktuálne pripravuje Ministerstvo školstva, vedy, výskumu a športu Slovenskej republiky, dôrazne odmietame a považujeme ju za snahu o politické ovládnutie vysokého školstva na Slovensku. Vyzývame predkladateľa novely, aby obnovil dialóg s tými, ktorých sa táto právna úprava bezprostredne týka, a aby ju v spolupráci s nimi prepracoval skôr, než ju predloží do legislatívneho procesu.

vyjadril sa k tomu aj rektor UK

Produkujeme školený personál pre priemysel? Budeme sa pri každých voľbách triasť, ktorej politickej strane pripadne ministerstvo školstva a či prispôsobí univerzity na svoj obraz? Alebo chceme samostatné, svojbytné a zodpovedné vysoké školstvo (hoci s chybami), ktoré dokáže vychovať vzdelaného človeka, ktorý vie myslieť a myslenie využíva ako nástroj na saturáciu svojej zvedavosti?

o korešpondenčných matematických seminároch

“Dištančné vzdelávanie nie je novinka roku 2020. Dokonca sme na Slovensku predbehli dobu počítačovú a už od roku 1982 sa u nás konajú korešpondenčné matematické semináre pre deti druhého stupňa základných škôl. Pôvodná myšlienka, vyhľadať talenty aj mimo veľkých miest a podchytiť ich systematickou spoločnou prácou sa postupne zmenila. Namiesto vyhľadávania talentov na ich pestovanie. Budovanie kladného vzťahu k matematike u detí, ale aj možnosť dobrovoľníckej práce pre vedúcich. To spolu vytvára silnú sieť mysliacich mladých ľudí, ktorí svoje kontakty pestujú do neskorej „dospelosti“. Konalo sa napríklad už 11 ročníkov konferencie „Slovak Oxford Science“, kde sa okrem iných stretávajú aj mnohí z bývalých účastníkov korešpondenčných seminárov na Slovensku,“ hovorí organizátorka korešpondenčných matematických seminárov doc. Katarína Bachratá z Fakulty riadenia a informatiky (FRI UNIZA).

Why You Should Take Any Vaccine

Since the beginning of the trials, all trials, there has not been a single death or hospitalization among people vaccinated. Not one. Zero. Not for Moderna, not for Pfizer/BioNTech, not for Oxford/AstraZeneca, not for Sputnik, not for J&J, not for Novavax.

ženy, ktoré ľutujú materstvo

Veci nie sú čierno-biele, záleží aj na kontexte. Figúrky na tomto obrázku majú rovnakú farbu (dá sa to skontrolovať napr tu):

pozerali sme s deťmi a všetkým sa páčilo:

akú chcem počúvať reperku

Vysvetlí ti, že zúfalosť diskusií na Modrom koníkovi nie je výsledkom laktačnej psychózy, ale zlyhávajúceho systému, v ktorom nás zdravotníctvo a školstvo necháva v týchto telách a v týchto vzťahoch bojovať na vlastnú päsť. 
Poradíme si teda samy.

Bez ohľadu na to, koľko je na scéne tatkov, otcov a oteckov, moja raperka nebude tvojou matkou. Dospieť musíš sám.

Aj tvoju mamku nechá na pokoji. Ak ti chýba jej kuchyňa, nauč sa variť, ona si recepty nepýta.
Nebude krkom, ktorý hýbe hlavou, má svoju vlastnú.
A ak ťa nepustí k slovu, tak to nie je preto, že je žena, ale preto, že má čo povedať. 
(Môžeš ju poprosiť o featy.)

Chcem, aby bola úplne normálne pekná. Dôkaz, že mozog a krása sa fakt nevylučujú. Že môže byť pekná žena, mať dobrý sex life a napriek tomu byť nasratá. Fakt to nie je o tom, že by si ju niekto nevšimol.

Víkendové surfovanie

path to herd immunity (model)

At the time herd immunity is reached, roughly half of the immunity will be achieved through natural infection, and the other half will be achieved through vaccination… This translates to a final US COVID-19 death toll of roughly 500,000 (±100,000) reported deaths, or ~200,000 additional deaths since mid-December 2020.

Statistics in the Pfizer Data – how good do they show the vaccine to be?

when I first started reading about possible vaccines many months ago, I never found any virologist who predicted we would have a vaccine that was more than than 70% effective. To have a vaccine that is likely about 95% effective for people 18-64 is nothing short of a medical miracle: we really lucked out…

So now let’s look at some individual lines from the table above and tease out just what the signal is. The major line is for people 18-64 and we had enough cases to say that our 94.6% efficacy average for the vaccine has a 95% confidence interval runs from 89.1 to 97.7. So what the biostatisicians who analyzed the data are telling us is that, roughly speaking, if we bet that this vaccine is between 89.1% and 97.7% effective for this group, this is an awfully good way to bet and we will win 95% of the time…

For people 65 to 74, while the average number (92.9%)  looks great, the confidence interval is not. It says that what we can say, roughly speaking, that a bet that the efficacy is between 53.2 to 99.8 is a good bet. Or, I would say you really don’t have a great way to bet. This kind of confidence interval says that didn’t have enough cases in this group to really say much at all and so the confidence range is too large to be really useful. 

And when we get to people over 75, what they describe isn’t a confidence interval, it’s a joke. A confidence interval of -12.1 to 100 is a lot like saying they threw a bunch of darts at a dart board at random and did everything from hit bystanders (i.e. the vaccine made things worse) to perfect protection. Who would make any bets on what is going on in this situation? They simply didn’t have enough cases to say anything meaningful and so what they say is just totally useless.

joylessness of cooking

In theory, I love to cook. I’ve been reminding myself of this lately, repeating it almost like a mantra,

I should have loved biology

I’ve never come across a subject so fractal in its complexity. It reminds me of computing that way. A day of programming might involve constructing an elaborate regular expression, investigating a file descriptor leak, debugging a race condition in the application you just wrote, and thinking through the interface of a module. Everywhere you look—the compiler, the shell, the CPU, the DOM—is an abstraction hiding lifetimes of work. Biology is like this, just much, much worse, because living systems aren’t intentionally designed. It’s all a big slop of global mutable state. Control is achieved by upregulating this thing while turning down the promoter of that thing’s repressor. You think you know how something works—like when I thought I had a handle on the neutrophil, an important front-line player in the innate immune system—only to learn that it comes in several flavors, and more are still being discovered, and some of them seem to do the opposite of the ones you thought you knew. Everything in biology is like this. It’s all exceptions to the rule.

Poland Uses Clams To Control Its Water Supply

the main water pump has 8 clams that have triggers attached to their shells. If the water gets too toxic, they close, and the triggers shut off the city’s water supply automatically

AlphaFold predicts the exact shape of proteins

Víkendové surfovanie

Only if researchers discovered no serious side effects would they start testing them in children, often beginning with teenagers, then working their way down to younger ages. Vaccine developers are keenly aware that children are not simply miniature adults. Their biology is different in ways that may affect the way vaccines work.

These trials allow vaccine developers to adjust the dose to achieve the best immune protection with the lowest risk of side effects. The doses that adults and children need are sometimes different — children get smaller doses of hepatitis B vaccines, for example, but bigger doses for pertussis.

rodičia nie sú návšteva

V súčasnosti sa na nás znova obracajú ženy, ktorým personál nemocnice bráni byť v kontakte so svojimi predčasne narodenými deťmi. Situácia z prvej vlny sa tak opakuje a znova dochádza k závažnému porušovaniu práv rodičov, ktoré majú vážne dopady na zdravie detí a psychické zdravie rodičov.

The Bit Player (Na tejto stránke je aj kopa iných voľne dostupných dokumentárnych filmov.)

In a blockbuster paper in 1948, Claude Shannon introduced the notion of a ‘bit’ and laid the foundation for the information age. His ideas ripple through nearly every aspect of modern life, influencing such diverse fields as communication, computing, cryptography, neuroscience, artificial intelligence, cosmology, linguistics, and genetics.

na zlepšenie prstokladu môžete nanovo napísať napríklad Annu zo zeleného domu

It Took Divorce to Make My Marriage Equal

leaf art – detailné obrázky vyrezávané do listov

Ministerka zdravotníctva Andrea Kalavská v parlamente o očkovaní

Fluór a chrí­pka

VykrútenáTak sme dnes boli zase v poradni, pozrieť doktora. Nemôžem si pomôcť, ale čím ďalej tým menej sa mi páči. Prvá vec bola, že sme došli 12:55, objednané sme boli na jednu a nikde nikoho. Čakali sme pred dverami do čakárne, kým sa všetci vrátili z obedňajšej prestávky. Potom nás šupli do vyšetrovne, ktorú ešte neupratali po poslednom pacientovi a doniesli zdravotnú kartu nejakej Sarah. Prišla sestrička, že malú Sarah pomeria a keď som jej vysvetlila, že Sarah dnes neprišla, tak sa vybrala na výpravu za našou kartou.

VykrútenáTakže až niekedy o pol druhej bola už pripravená aj vyšetrovňa, aj karta, aj sestrička. Tá pomerala, čo bolo treba, a vyšlo jej 10.9kg a 74cm. Potom prišiel doktor, popozeral, popočúval, nalial Kike očkovanie proti obrne do pusy a strelil tri injekcie. Štvrtú – chrípku – som odmietla. Na to ma informoval, že si myslí, že si pre ňu ešte prídeme, lebo že nás bez nej nepustia do jaslí.

S tou chrípkou je to tak, že zloženie vakcíny sa vyberá takmer rok dopredu. Idú do nej tri typy chrípky, ktoré začiatkom roka Global Influenza Surveillance Network odhadne, že budú najrozšírenejšie nasledujúcu sezónu. Tento rok boli odhady úplne mimo, lebo nezahrnuli prasaciu chrípku (ani nemohli, lebo tá sa poriadne ukázala až potom, čo už bolo rozhodnuté a urýchlene sa dodatočne začala výroba vakcíny aj proti nej). Napriek tomu, odporúčania ostali nezmenené – treba sa vraj zaočkovať aj tou sezónnou a keď bude dostupná, tak aj prasacou.

Pritom prvá otázka, ktorá ma napadne je, že keď sa toľko ľudí očkuje, nemala by už chrípka byť vpodstate vyničená? Tak je tomu s vä荹inou detských ochorení, proti ktorým sa očkuje. Ale na chrípku napriek očkovaniam každý rok ochorie približne rovnaký počet ľudí a mnoho z nich sú deti, ktoré boli zaočkované. Problém je práve v tom, ako chrípka mutuje a vracia sa stále v nových a nových verziách (k čomu možno práve očkovaniami a imunitou voči tým starým sami prispievame).

Uvidíme, čo nám povedia v jasliach (nerada by som sa totiž uchyľovala k nejakým vyhláseniam, že mi moje náboženské presvedčenie nedovoľuje očkovať proti chrípke), ale zdá sa mi, že vitamín D a časté umývanie rúk sú v tomto prípade lepšou prevenciou ako očkovanie.

Nuž a čím ma doktor potom dorazil, bol fluór. Napísal nám recept na nejaké vitamíny s prídavkom fluóru, ktoré vraj máme Kike dávať. Nejako veľmi nevysvetľoval a ja som nevedela, ako reagovať, lebo jediné, čo ma v danej chvíli napadlo bolo to, že na každej zubnej paste s fluórom je napísané, že keď dieťa prehltne viac ako “hrášok” pasty, tak mám volať Poison Control (tam treba volať aj keď vypije záchodový čistič alebo poje lieky na srdce starého otca…).

Keď som prišla domov, tak som sa spýtala googla a ten v zásade povedal, že celkový prísun fluóru je ťažko odhadnúť, lebo sa nachádza aj vo všetkej strave a pitnej vode (áno, Kika toho zatiaľ veľa nepoje ale časom bude aj to) a nadmerné množstvá vedú k nevratnej fluoróze. Okrem toho, nové zistenia ukazujú, že pozitívne účinky fluóru sú akurát z natierania zubov a nie vnútorného užívania a ani Americká Zubná Asociácia neodporúča paušálne fluórové doplnky pre všetkých, ale iba pre deti, ktoré žijú v oblastiach, kde nie je voda fluorovaná. Takže aj tieto nové vitamíny zatiaľ preskočíme.

Podobne ako minule, ani teraz sa ma nespýtal, či sa Kika prevracia, smeje alebo sedí a na moju otázku, ako sa najlepšie vysporiadať s jetlagom – časovým posunom – odpovedal, že nesnažiť sa ju prerobiť na miestny európsky čas, ale nechať ju fungovať na tunajšom, keďže sa jedná len o pártýždňový výlet. Tak neviem, či to malo znamenať, že ju budeme nechávať spať do 12 na obed a kúpať začneme niekedy o polnoci… Náš plán je zatiaľ práve naopak – nesnažiť sa nejako drasticky, ale smerovať k tomu, aby spala, keď je tma a bola hore, keď je svetlo. Uvidíme.

Ešte dve videá. Snaha bola zachytiť, ako Kika začína bľabotať, ale to sa veľmi nepodarilo – iba na tom prvom na konci je kúsok: