Víkendové surfovanie

path to herd immunity (model)

At the time herd immunity is reached, roughly half of the immunity will be achieved through natural infection, and the other half will be achieved through vaccination… This translates to a final US COVID-19 death toll of roughly 500,000 (±100,000) reported deaths, or ~200,000 additional deaths since mid-December 2020.

Statistics in the Pfizer Data – how good do they show the vaccine to be?

when I first started reading about possible vaccines many months ago, I never found any virologist who predicted we would have a vaccine that was more than than 70% effective. To have a vaccine that is likely about 95% effective for people 18-64 is nothing short of a medical miracle: we really lucked out…

So now let’s look at some individual lines from the table above and tease out just what the signal is. The major line is for people 18-64 and we had enough cases to say that our 94.6% efficacy average for the vaccine has a 95% confidence interval runs from 89.1 to 97.7. So what the biostatisicians who analyzed the data are telling us is that, roughly speaking, if we bet that this vaccine is between 89.1% and 97.7% effective for this group, this is an awfully good way to bet and we will win 95% of the time…

For people 65 to 74, while the average number (92.9%)  looks great, the confidence interval is not. It says that what we can say, roughly speaking, that a bet that the efficacy is between 53.2 to 99.8 is a good bet. Or, I would say you really don’t have a great way to bet. This kind of confidence interval says that didn’t have enough cases in this group to really say much at all and so the confidence range is too large to be really useful. 

And when we get to people over 75, what they describe isn’t a confidence interval, it’s a joke. A confidence interval of -12.1 to 100 is a lot like saying they threw a bunch of darts at a dart board at random and did everything from hit bystanders (i.e. the vaccine made things worse) to perfect protection. Who would make any bets on what is going on in this situation? They simply didn’t have enough cases to say anything meaningful and so what they say is just totally useless.

joylessness of cooking

In theory, I love to cook. I’ve been reminding myself of this lately, repeating it almost like a mantra,

I should have loved biology

I’ve never come across a subject so fractal in its complexity. It reminds me of computing that way. A day of programming might involve constructing an elaborate regular expression, investigating a file descriptor leak, debugging a race condition in the application you just wrote, and thinking through the interface of a module. Everywhere you look—the compiler, the shell, the CPU, the DOM—is an abstraction hiding lifetimes of work. Biology is like this, just much, much worse, because living systems aren’t intentionally designed. It’s all a big slop of global mutable state. Control is achieved by upregulating this thing while turning down the promoter of that thing’s repressor. You think you know how something works—like when I thought I had a handle on the neutrophil, an important front-line player in the innate immune system—only to learn that it comes in several flavors, and more are still being discovered, and some of them seem to do the opposite of the ones you thought you knew. Everything in biology is like this. It’s all exceptions to the rule.

Poland Uses Clams To Control Its Water Supply

the main water pump has 8 clams that have triggers attached to their shells. If the water gets too toxic, they close, and the triggers shut off the city’s water supply automatically

AlphaFold predicts the exact shape of proteins

Víkendové surfovanie

Only if researchers discovered no serious side effects would they start testing them in children, often beginning with teenagers, then working their way down to younger ages. Vaccine developers are keenly aware that children are not simply miniature adults. Their biology is different in ways that may affect the way vaccines work.

These trials allow vaccine developers to adjust the dose to achieve the best immune protection with the lowest risk of side effects. The doses that adults and children need are sometimes different — children get smaller doses of hepatitis B vaccines, for example, but bigger doses for pertussis.

rodičia nie sú návšteva

V súčasnosti sa na nás znova obracajú ženy, ktorým personál nemocnice bráni byť v kontakte so svojimi predčasne narodenými deťmi. Situácia z prvej vlny sa tak opakuje a znova dochádza k závažnému porušovaniu práv rodičov, ktoré majú vážne dopady na zdravie detí a psychické zdravie rodičov.

The Bit Player (Na tejto stránke je aj kopa iných voľne dostupných dokumentárnych filmov.)

In a blockbuster paper in 1948, Claude Shannon introduced the notion of a ‘bit’ and laid the foundation for the information age. His ideas ripple through nearly every aspect of modern life, influencing such diverse fields as communication, computing, cryptography, neuroscience, artificial intelligence, cosmology, linguistics, and genetics.

na zlepšenie prstokladu môžete nanovo napísať napríklad Annu zo zeleného domu

It Took Divorce to Make My Marriage Equal

leaf art – detailné obrázky vyrezávané do listov

Ministerka zdravotníctva Andrea Kalavská v parlamente o očkovaní

Fluór a chrí­pka

VykrútenáTak sme dnes boli zase v poradni, pozrieť doktora. Nemôžem si pomôcť, ale čím ďalej tým menej sa mi páči. Prvá vec bola, že sme došli 12:55, objednané sme boli na jednu a nikde nikoho. Čakali sme pred dverami do čakárne, kým sa všetci vrátili z obedňajšej prestávky. Potom nás šupli do vyšetrovne, ktorú ešte neupratali po poslednom pacientovi a doniesli zdravotnú kartu nejakej Sarah. Prišla sestrička, že malú Sarah pomeria a keď som jej vysvetlila, že Sarah dnes neprišla, tak sa vybrala na výpravu za našou kartou.

VykrútenáTakže až niekedy o pol druhej bola už pripravená aj vyšetrovňa, aj karta, aj sestrička. Tá pomerala, čo bolo treba, a vyšlo jej 10.9kg a 74cm. Potom prišiel doktor, popozeral, popočúval, nalial Kike očkovanie proti obrne do pusy a strelil tri injekcie. Štvrtú – chrípku – som odmietla. Na to ma informoval, že si myslí, že si pre ňu ešte prídeme, lebo že nás bez nej nepustia do jaslí.

S tou chrípkou je to tak, že zloženie vakcíny sa vyberá takmer rok dopredu. Idú do nej tri typy chrípky, ktoré začiatkom roka Global Influenza Surveillance Network odhadne, že budú najrozšírenejšie nasledujúcu sezónu. Tento rok boli odhady úplne mimo, lebo nezahrnuli prasaciu chrípku (ani nemohli, lebo tá sa poriadne ukázala až potom, čo už bolo rozhodnuté a urýchlene sa dodatočne začala výroba vakcíny aj proti nej). Napriek tomu, odporúčania ostali nezmenené – treba sa vraj zaočkovať aj tou sezónnou a keď bude dostupná, tak aj prasacou.

Pritom prvá otázka, ktorá ma napadne je, že keď sa toľko ľudí očkuje, nemala by už chrípka byť vpodstate vyničená? Tak je tomu s vä荹inou detských ochorení, proti ktorým sa očkuje. Ale na chrípku napriek očkovaniam každý rok ochorie približne rovnaký počet ľudí a mnoho z nich sú deti, ktoré boli zaočkované. Problém je práve v tom, ako chrípka mutuje a vracia sa stále v nových a nových verziách (k čomu možno práve očkovaniami a imunitou voči tým starým sami prispievame).

Uvidíme, čo nám povedia v jasliach (nerada by som sa totiž uchyľovala k nejakým vyhláseniam, že mi moje náboženské presvedčenie nedovoľuje očkovať proti chrípke), ale zdá sa mi, že vitamín D a časté umývanie rúk sú v tomto prípade lepšou prevenciou ako očkovanie.

Nuž a čím ma doktor potom dorazil, bol fluór. Napísal nám recept na nejaké vitamíny s prídavkom fluóru, ktoré vraj máme Kike dávať. Nejako veľmi nevysvetľoval a ja som nevedela, ako reagovať, lebo jediné, čo ma v danej chvíli napadlo bolo to, že na každej zubnej paste s fluórom je napísané, že keď dieťa prehltne viac ako “hrášok” pasty, tak mám volať Poison Control (tam treba volať aj keď vypije záchodový čistič alebo poje lieky na srdce starého otca…).

Keď som prišla domov, tak som sa spýtala googla a ten v zásade povedal, že celkový prísun fluóru je ťažko odhadnúť, lebo sa nachádza aj vo všetkej strave a pitnej vode (áno, Kika toho zatiaľ veľa nepoje ale časom bude aj to) a nadmerné množstvá vedú k nevratnej fluoróze. Okrem toho, nové zistenia ukazujú, že pozitívne účinky fluóru sú akurát z natierania zubov a nie vnútorného užívania a ani Americká Zubná Asociácia neodporúča paušálne fluórové doplnky pre všetkých, ale iba pre deti, ktoré žijú v oblastiach, kde nie je voda fluorovaná. Takže aj tieto nové vitamíny zatiaľ preskočíme.

Podobne ako minule, ani teraz sa ma nespýtal, či sa Kika prevracia, smeje alebo sedí a na moju otázku, ako sa najlepšie vysporiadať s jetlagom – časovým posunom – odpovedal, že nesnažiť sa ju prerobiť na miestny európsky čas, ale nechať ju fungovať na tunajšom, keďže sa jedná len o pártýždňový výlet. Tak neviem, či to malo znamenať, že ju budeme nechávať spať do 12 na obed a kúpať začneme niekedy o polnoci… Náš plán je zatiaľ práve naopak – nesnažiť sa nejako drasticky, ale smerovať k tomu, aby spala, keď je tma a bola hore, keď je svetlo. Uvidíme.

Ešte dve videá. Snaha bola zachytiť, ako Kika začína bľabotať, ale to sa veľmi nepodarilo – iba na tom prvom na konci je kúsok: